Mikhtaniuk S.E., Безродный В.В., Fatullaev E.I., Sheveleva N.N., Маркелов Денис Д.А., Neelov I.M., Shavykin O.V. MD Simulation Study of Complex Formation Between LysHisArg Dendrimer and Molecules of AlaGluAspGly Bioactive Peptide. 2024 International Conference on Applied Mathematics & Computer Science, IEEE XPLORE. 2024. pp. 149-155.
Mikhtaniuk S.E., Kantakov I.M., Fatullaev E.I., Neelov I.M. Study of Complex of AEDG Tetrapeptide and Lysine Dendrimer with RH Dipeptide Spacer at Two Different pH by Computer Simulation. IEEE Xplore. 2024. pp. 1-8.
Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Shavykin O.V., Sheveleva N.N., Markelov D.A., Neelov I.M. A Molecular Dynamics Simulation of Complexes of Fullerenes and Lysine-Based Peptide Dendrimers with and without Glycine Spacers. International Journal of Molecular Sciences. 2024. Vol. 25. No. 2. pp. 691.
Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Fatullaev E.I., Shavykin O.V., Neelov I.M., Sheveleva N.N. Molecular dynamic simulation of complexes lysine-based dendrimers with fullerenes C60. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2024: Proceedings 21th International School-Conference (Saint Petersburg, 1-5 fапреля 2024 г.). 2024. pp. 202-204.
Sheveleva N.N., Konarev P.V., Boyko K.M., Tarasenko I.I., Mikhailova M.E., Bezrodnyi V.V., Shavykin O.V., Neelov I.M., Markelov D.A. SAXS, DLS, and MD studies of the Rg/Rh ratio for swollen and collapsed dendrimers. Journal of Chemical Physics. 2024. Vol. 161. No. 19. pp. 194901.
Molecular dynamics simulation of new lysine dendrimers with dipeptide spacers
Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Bezrodnyi V.V., Shavykin V.V., Neelov I.M. Investigation of complex formation by Lys-2Leu dendrimer with oligopeptides of different degree of hydrophobicity. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2023: Proceedings 20th International School-Conference (Saint Petersburg, 27-30 марта 2023 г.). 2023. pp. 206-208.
Shavykin O.V., Mikhtaniuk S.E., Fatullaev E.I., Neelov I.M., Leermarkers F., Brito M., Holm C., Borisov O.V., Darinskii A.A. Hybrid Molecules Consisting of Lysine Dendrons with Several Hydrophobic Tails: A SCF Study of Self-Assembling. International Journal of Molecular Sciences. 2023. Vol. 24. No. 3. pp. 2078.
Brito M., Mikhtaniuk S.E., Neelov I.M., Borisov O.V., Holm C. Implicit-Solvent Coarse-Grained Simulations of Linear–Dendritic Block Copolymer Micelles. International Journal of Molecular Sciences. 2023. Vol. 24. No. 3. pp. 2763.
Михтанюк С.Е., Щербань-Филимошкин В.А., Шавыкин О.В., Неелов И.М. МД моделирование взаимодействия пептидного дендримера Lys2Leu с биоактивными пептидами. Сборник научных трудов VII Съезда биофизиков России: в 2x томах (Краснодар, 17-23 апреля 2023 г.). 2023. Т. 1. С. 296.
Mikhtaniuk S.E., Fatullaev E.I., Bezrodnyi V.V., Shavykin V.V., Darinskii A.A., Neelov I.M. The SCF study of micelle formation of the amphiphilic hybrid molecules consisting of a polylysine dendron with several hydrophobic tails. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2023: Proceedings 20th International School-Conference (Saint Petersburg, 27-30 марта 2023 г.). 2023. pp. 209-211.
Fatullaev E.I., Shavykin O.V., Neelov I.M. Molecular Dynamics of Lysine Dendrigrafts in Methanol–Water Mixtures. International Journal of Molecular Sciences. 2023. Vol. 24. No. 4. pp. 3063.
Mikhtaniuk S.E., Bezrodniy V.V., Shavykin O.V., Fatullaev E.I., Neelov I.M. Computer Simulation of New Terminally Charged Peptide Dendrimers with Neutral Spacers. 8th International Conference on Mathematics and Computers in Sciences and Industry (MCSI). 2023. pp. 44-51.
Sheveleva N.N., Tarasenko I.I., Vovk M.A., Mikhailova M.E., Neelov I.M., Markelov D.A. NMR Studies of Two Lysine Based Dendrimers with Insertion of Similar Histidine-Arginine and Arginine-Histidine Spacers Having Different Properties for Application in Drug Delivery. International Journal of Molecular Sciences. 2023. Vol. 24. No. 2. pp. 949.
Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Shavykin V.V., Neelov I.M., Darinskii A.A., Sheveleva N.N., Markelov D.A. Molecular dynamics simulation of global and local dynamics in lysine based peptide dendrimers with neutral and protonized histidine. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2023: Proceedings 20th International School-Conference (Saint Petersburg, 27-30 марта 2023 г.). 2023. pp. 166-168.
Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Bezrodnyi V.V., Shavykin V.V., Neelov I.M. Molecular dynamics study of complex formation of the dendrigraft DG2 with charged oligopeptides AED, GED and ED. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2023: Proceedings 20th International School-Conference (Saint Petersburg, 27-30 марта 2023 г.). 2023. pp. 202-205.
Михтанюк С.Е., Фатуллаев Э.И., Шавыкин О.В., Неелов И.М. Моделирование саморганизации гибридных молекул, состоящих из лизинового дендрона с несколькими гидрофобными хвостами. Сборник научных трудов VII Съезда биофизиков России: в 2x томах (Краснодар, 17-23 апреля 2023 г.). 2023. Т. 1. С. 308-309.
Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Shavykin O.V., Neelov I.M., Darinskii A.A., Sheveleva N.N., Markelov D.A. Histidine-rich lysine-based dendrimer and its interaction with molecules of therapeutic tetrapeptide at two different pH. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2022: Proceedings 19th International School-Conference (Saint Petersburg, 28 марта – 1 апреля 2022 г.). 2022. pp. 186-188.
Installation and Application of Computer Programs for MD Simaulations
Molecular Dynamics Simulations of Peptides in GROMACS
Fatullaev E.I., Bezrodnyi V.V., Neelov I.M. MD Simulation of AEDG Peptide Complexes with New K2R Dendrimer and Dendrigraft. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2022. Vol. 16. pp. 73-81.
Молекулярно динамическое моделирование наноконтейнера на основе дендримера, содержащего лейциновые аминокислотные остатки
Shavykin O.V., Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Darinskii A.A., Neelov I.M., Sheveleva N.N., Markelov D.A. The local orientational mobility of collapsed and swollen lysine based dendrimer with double histidine insertions. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2022: Proceedings 19th International School-Conference (Saint Petersburg, 28 марта – 1 апреля 2022 г.). 2022. pp. 149-151.
Fatullaev E.I., Shavykin O.V., Darinskii A.A., Neelov I.M. The Brownian dynamics and numerical self-consistent field simulations of the dendrigraft nanocontainers. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2021: Proceedings 18th International School-Conference. 2021. pp. 196-198.
Bezrodnyi V.V., Shavykin O.V., Neelov I.M. Novel lysine-based peptide dendrimers modeled by the self-consistent field approach. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2021: Proceedings 18th International School-Conference. 2021. pp. 185-187.
Synthesis, computer simulation and NMR study of novel peptide dendrimers with arginine and histidine spacers designed for drug and gene delivery; https://doi.org/10.1021/scimeetings.1c00499
Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Shavykin O.V., Neelov I.M., Sheveleva N.N., Markelov D.A. Computer simulation and NMR study of the temperature dependencies of the structural and dynamic characteristics of Lys2Arg peptide dendrimers. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2021: Proceedings 18th International School-Conference. 2021. pp. 182-184.
Tarabukina E., Fatullaev E.I., Krasova A., Sokolova M., Kurlykin M., Neelov I.M., Tenkovtsev A., Filippov A. Thermoresponsive molecular brushes with a rigid-chain aromatic polyester backbone and poly-2-alkyl-2-oxazoline side chains. International Journal of Molecular Sciences. 2021. Vol. 22. No. 22. pp. 12265.
Фатуллаев Э.И., Михтанюк С.Е., Неелов И.М. Молекулы AED-пептида образуют стабильный комплекс с лизиновым дендриграфтом. Новые научные исследования: сборник статей III Международной научно-практической конференции (Пенза, 17июня 2021г.). 2021. С. 18-23.
Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Shavykin O.V., Neelov I.M., Sheveleva N.N., Markelov D.A. Size and Structure of Empty and Filled Nanocontainer Based on Peptide Dendrimer with Histidine Spacers at Different pH. Molecules. 2021. Vol. 26. No. 21. pp. 6552.
Mikhtaniuk S.E., Bezrodnyi V.V., Shavykin O.V., Neelov I.M., Sheveleva N.N., Markelov D.A. The structural and dynamic characteristics of Lys2Gly and Lys2Lys peptide dendrimers. The molecular dynamics simulation at different temperatures. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2021: Proceedings 18th International School-Conference. 2021. pp. 231-233.
Фатуллаев Э.И., Михтанюк С.Е., Неелов И.М. Взаимодействие GED-пептида с лизиновым дендримером. Прорывные научные исследования: актуальные вопросы теории и практики: сборник статей Международной научно-практической конференции (Пенза, 30декабря 2021г.). 2021. С. 10-16.
Sheveleva N.N., Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Shavykin O.V., Neelov I.M., Tarasenko I.I., Vovk M.A., Mikhailova M.E., Penkova A.V., Markelov D.A. Local Orientational Mobility of Collapsed Dendrimers. Macromolecules. 2021. Vol. 54. No. 23. pp. 11083-11092.
Molecular Dynamics&NMR of Peptide Dendrimers with Dipeptide Spacers
Mikhtaniuk S.E., Fatullaev E.I., Shavykin O.V., Darinskii A.A., Holm C., Neelov I.M. The self-assembly of the amphiphilic molecules consisting of polylysine dendrons with the single and double hydrophobic tails. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2021: Proceedings 18th International School-Conference. 2021. pp. 234-236.
Фатуллаев Э.И., Безродный В.В., Неелов И.М. Моделирование комплекса дендримера с пептидом. Chemical Bulletin. 2021. Т. 4. № 2. С. 37-47.
Okrugin B.M., Richter R.P., Leermakers F., Neelov I.M., Zhulina E.B., Borisov O.V. Electroresponsive polyelectrolyte brushes studied by self-consistent field theory. Polymers. 2020. Vol. 12. No. 4. pp. 898.
Shavykin O.V., Neelov I.M., Borisov O.V., Darinskii A.A., Leermakers F. SCF Theory of Uniformly Charged Dendrimers: Impact of Asymmetry of Branching, Generation Number, and Salt Concentration. Macromolecules. 2020. Vol. 53. No. 17. pp. 7298-7311.
Mikhtaniuk S.E., Bezrodniy V.V., Shavykin O.V., Neelov I.M., Sheveleva N.N., Penkova A.V., Markelov D.A. Comparison of Structure and Local Dynamics of Two Peptide Dendrimers with the Same Backbone but with Different Side Groups in Their Spacers. Polymers. 2020. Vol. 12. No. 8. pp. 1657.
Synthesis, computer simulation and NMR study of new peptide dendrimers for drug and gene delivery; https://doi.org/10.1021/scimeetings.0c06692
Bezrodniy V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Tarasenko I.I., Neelov I.M. Interaction of lysine dendrimer with 8 and 16 molecules of EDR peptide. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2020. Vol. 14. pp. 1-6.
Безродный В.В., Шавыкин О.В., Неелов И.М. Численный метод оптимизации равновесных свойств лизинового дендримера второго поколения. Перспективы развития математического образования в эпоху цифровой трансформации: материалы Всероссийской научно-практической конференции (Тверь, 27-28марта 2020г.). 2020. С. 32-36.
Bezrodniy V.V., Fatullaev E.I., Shavykin O.V., Neelov I.M. Molecular dynamics simulation of global and local dynamics in lysine-based dendrimers with double argenine and double histidine. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2020: Proceedings 17th International Youth School-Conference (Saint Petersburg, 29March-3April, 2020) [сборник трудов]. 2020. pp. 152-154.
Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Shavykin O.V., Neelov I.M. The orientational dynamics in the dipeptides: the role of type of the side chains. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2020: Proceedings 17th International Youth School-Conference (Saint Petersburg, 29March-3April, 2020) [сборник трудов]. 2020. pp. 155-157.
Mikhtaniuk S.E., Bezrodniy V.V., Fatullaev E.I., Neelov I.M. Computer simulation of interaction of lysine dendrimer with molecules of Gly-Glu-Asp peptide. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2020: Proceedings 17th International Youth School-Conference (Saint Petersburg, 29March-3April, 2020) [сборник трудов]. 2020. pp. 217-220.
Mikhtaniuk S.E., Bezrodnyi V.V., Shavykin O.V., Neelov I.M. Computer simulation of orientational dynamics in the peptide dendrmers with different excluded volume interactions. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2020: Proceedings 17th International Youth School-Conference (Saint Petersburg, 29March-3April, 2020) [сборник трудов]. 2020. pp. 221-223.
Gorzkiewicz M., Konopka M., Janaszewska A., Tarasenko I.I., Sheveleva N.N., Gajek A., Neelov I.M., Klajnert-Maculewicz B. Application of new lysine-based peptide dendrimers D3K2 and D3G2 for gene delivery: Specific cytotoxicity to cancer cells and transfection in vitro. Bioorganic Chemistry. 2020. Vol. 95. pp. 103504.
Computer simulation of interaction of lysine dendrimer with molecules of Gly-Glu-Asp peptide
Безродный В.В., Фатуллаев Э.И., Михтанюк С.Е., Неелов И.М. Взаимодействие лизинового дендримера G2 c 8 EDR-пептидами. Прорывные научные исследования: проблемы, закономерности, перспективы: сборник статей XV Международной научно-практической конференции (Пенза, 30декабря 2020г.) [заочная конф]. 2020. Т. часть 1. С. 19-24.
Bezrodnyi V.V., Shavykin O.V., Mikhtaniuk S.E., Neelov I.M., Sheveleva N.N., Markelov D.A. Why the orientational mobility in arginine and lysine spacers of peptide dendrimers designed for gene delivery is different?. International Journal of Molecular Sciences. 2020. Vol. 21. No. 24. pp. 9749.
Gorzkiewicz M., Kopeс O., Janaszewska A., Konopka M., Pedziwiatr-Werbicka E., Tarasenko I.I., Bezrodnyi V.V., Neelov I.M., Klajnert-Maculewicz B. Poly(lysine) Dendrimers Form Complexes with siRNA and Provide Its Effcient Uptake by Myeloid Cells: Model Studies for Therapeutic Nucleic Acid Delivery. International Journal of Molecular Sciences. 2020. Vol. 21. No. 9. pp. 3138.
Bezrodnyi V.V., Shavykin O.V., Mikhtaniuk S.E., Neelov I.M., Markelov D.A. Molecular Dynamics and Spin-Lattice NMR Relaxation in alpha- and epsilon-Polylysine. Applied Magnetic Resonance. 2020. Vol. 51. No. 12. pp. 1669-1679.
Фатуллаев Э.И., Гузнева И.И., Михтанюк С.Е., Неелов И.М. Комплекс дендриграфта DG2 с 16 DS-пептидами. Прорывные научные исследования: проблемы, закономерности, перспективы: сборник статей XV Международной научно-практической конференции (Пенза, 30декабря 2020г.) [заочная конф]. 2020. Т. часть 1. С. 25-29.
Lebedeva I.O., Shavykin O.V., Neelov I.M., Zhulina E.B., Leermakers F., Borisov O.V. Non-linear elasticity effects and stratification in brushes of branched polyelectrolytes. Journal of Chemical Physics. 2019. Vol. 151. No. 21. pp. 214902.
Молекулярная динамика для начинающих
Molecular dynamics simulation of global and local dynamics in dendrigraft of second generation
Молекулярно-динамической моделирование взаимодействия дендриграфта второго поколения с молекулами пептида LVFFAE
Investigation of complex of lysine dendrimer of 2nd generation with 8 molecules of therapeutic vezugen peptide by computer simulation
Investigation of complex of lysine dendrimer of 2nd generation with molecules of therapeutic KED peptide by computer simulation
Sheveleva N.N., Markelov D.A., Vovk M.A., Tarasenko I.I., Mikhailova M.Y., Ilyash M., Neelov I.M., Lahderanta E. Stable Deuterium Labeling of Histidine-Rich Lysine-Based Dendrimers. Molecules. 2019. Vol. 24. No. 13. pp. 2481.
Поведение в растворах и термочувствительность ароматического полиэфира с привитыми цепями поли-2-изопропилоксазолина
Михтанюк С.Е., Неелов И.М. Изучение комплекса молекул лекарственного трипептида KED с лизиновым дендриграфтом с помощью компьютерного моделирования. Молодежь в науке: новые аргументы: сборник научных работ X Международного молодежного конкурса (Липецк, 1марта 2019г.). 2019. Т. Секции 1-3. С. 191-193.
Khamidova D.N., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Neelov I.M. Interaction of dendrigraft of second generation with molecules of LVFFAE peptide. Molecular dynamics simulation. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2019: proceedings (16th International Youth School-Conference, Saint Petersburg, 31March-5April, 2019) [сборник тезисов]. 2019. pp. 185-187.
Shavykin O.V., Bezrodniy V.V., Mikhtaniuk S.E., Neelov I.M., Markelov D.A. Computer simulation of orientational dynamics in alpha- and epsilon-lysine peptides. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2019: proceedings (16th International Youth School-Conference, Saint Petersburg, 31March-5April, 2019) [сборник тезисов]. 2019. pp. 245-247.
Molecular dynamics simulation of global and local dynamics in dendrigraft of sеcond generation
Изучение ориентационной подвижности лизинового дендриграфта 2-го поколения
Исследование комплекса лизинового дендримера 2-го поколения с молекулами терапевтического пептида методом компьютерного моделирования
Сравнение размеров и локальной подвижности линейных альфа- и эпсилон лизиновых пептидов одинаковой молекулярной массы
Mikhtaniuk S.E., Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Marchenko A.A., Bychkova E.I., Neelov I.M. Investigation of complex of lysine dendrimer of 2nd generation with 8 molecules of therapeutic vezugen peptide by computer simulation. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2019: proceedings (16th International Youth School-Conference, Saint Petersburg, 31March-5April, 2019) [сборник тезисов]. 2019. pp. 213-215.
Neelov I.M., Ilyash M.J., Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Marchenko A.A., Bychkova E.I., Mikhtaniuk S.E. Investigation of complex of lysine dendrimer of 2nd generation with molecules of therapeutic KED peptide by computer simulation. Journal of Physics: Conference Series. 2019. Vol. 1334. No. 1. pp. 012012.
Ильяш М.Ю., Хамидова Д.Н., Безродный В.В., Фатуллаев Э.И., Михтанюк С.Е., Неелов И.М. Компьютерное моделирование взаимодействия лизиновых дендриграфтов с молекулами амилоидных пептидов. Известия Санкт-Петербургского государственного технологического института (технического университета). 2019. № 50(76). С. 85-91.
Ilyash M.Y., Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E., Tarasenko I.I., Neelov I.M. Computer simulation of complexation of lysine dendrigraft of second generation with DS dipeptide molecules. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2019. Vol. 13. pp. 63-69.
Neelov I.M., Ilyash M.Y., Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E. Computer Simulation of Complex of Lysine Dendrimer with Molecules of Therapeutic KED Peptide. WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine. 2019. Vol. 16. pp. 56-60.
Neelov I.M., Ilyash M.Y., Bezrodnyi V.V., Fatullaev E.I., Mikhtaniuk S.E. Advanced Analysis of Complex of Lysine Dendrimer With Molecules of Therapeutic KED Peptide. Computer Simulation. Applications. WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine. 2019. Vol. 16. pp. 56-60.
Thermosensitivity of hybrid molecular brushes with polyoxasoline side chains
Properties in solutions of thermoresponsive poly-2-isopropyl oxazoline grafted block copolymer
Фатуллаев Э.И., Неелов И.М. Молекулярно-динамическое моделирование взаимодействия дендриграфта второго поколения с молекулами пептида LVFFAE. Молодежь в науке: новые аргументы: сборник научных работ X Международного молодежного конкурса (Липецк, 1марта 2019г.). 2019. Т. Секции 3-8. С. 23-25.
Neelov I., Khamidova D., Bezrodnyi V., Mikhtaniuk S. Molecular Dynamics Simulation of Interaction of Lysine Dendrigraft of 2nd Generation with Stack of Amyloid Peptides. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2019. Vol. 13. pp. 26-31.
The manifestations of the asymmetry of branching in the structure of charged dendrimers modeled by the self-consistent field approach
Sheveleva N.N., Markelov D.A., Vovk M.A., Mikhailova M.E., Tarasenko I.I., Толстой П., Neelov I.M., Lahderanta E., Lahderanta E. Lysine-based dendrimer with double arginine residues. RSC Advances. 2019. Vol. 9. No. 31. pp. 18018-18026.
Neelov I., Bezrodnyi V., Marchenko A., Fatullaev E., Miktaniuk S. Computer simulation of complex of lysine dendrigraft with molecules of therapeutic KED peptide. ITM Web of Conferences. 2019. Vol. 24. pp. 02008.
Сравнение результатов, полученных методом самосогласованного поля, с экспериментальными данными по МУРН дендромицелл
Sheveleva N.N., Markelov D.A., Vovk M.A., Mikhailova M.E., Tarasenko I.I., Neelov I.M., Lahderanta E. NMR studies of excluded volume interactions in peptide dendrimers. Scientific Reports. 2018. Vol. 8. pp. 8916.
Shavykin O.V., Mikhailov I.V., Darinskii A.A., Neelov I.M., Leermakers F.A. Effect of an asymmetry of branching on structural characteristics of dendrimers revealed by Brownian dynamics simulations. Polymer. 2018. Vol. 146. pp. 256-266.
Моделирование биополимеров (руководство к практическим и лабораторным работам)
Influence of the charged peptide dendrigrafts topology on the large-scale properties and thir internal structure
Study of local orientation mobility in lysine dendrimers by NMR methods
Influence of the asymmetry of branching on the structural properties of dendrimers.Brownian dynamics simulation
Okrugin B.M., Ilyash M., Markelov D.A., Neelov I.M. Lysine dendrigraft nanocontainers. Influence of topology on their size and internal structure. Pharmaceutics. 2018. Vol. 10. No. 3. pp. 129.
Influence of the asymmetry of branching on the structural properties of dendrimers. Brownian dynamics simulation
Influence of the charged peptide dendrigraft topology on the large-scale properties and their internal structure
Comparison of size and other properties of lysine dendrimers and short lysine dendritic brush
Effect of dendrimer generation on the kinetics of peptide complex formation
Neelov I.M., Shavykin O.V., Ilyash M.Y., Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Marchenko A.A., Fatullaev E.I., Darinskii A.A., Leermakers F.A. Application of High Performance Computing for Comparison of Two Highly Branched Lysine Molecules of Different Topology. Supercomputing Frontiers and Innovations. 2018. Vol. 5. No. 3. pp. 60-64.
Zhulina E.B., Neelov I.M., Sheiko S.S., Borisov O.V. Planar brush of end-tethered molecular bottle-brushes. Scaling model. Polymer Science - Series C. 2018. Vol. 60. No. Suppl.1. pp. 76-83.
Shavykin O.V., Leermakers F.A., Neelov I.M., Darinskii A.A. Self-assembly of lysine-based dendritic surfactants modeled by the self-consistent field approach. Langmuir. 2018. Vol. 34. No. 4. pp. 1613–1626.
Study of local orientational mobility in lysine dendrimers by NMR method
Computer simulation of complex of lysine dendrigraft with molecules of therapeutic KED peptide
Neelov I., Khamidova D., Popova E.V., Komilov F. Computer Simulation of Interaction of Lysine Dendrimer with Stack of Amyloid Peptides. Proceedings - 2017 4th International Conference on Mathematics and Computers in Sciences and in Industry, MCSI 2017. 2018. Vol. 2018. pp. 183-188.
Neelov I.M., Popova E.V., Khamidova D.N. Complexes and conjugates of lysine dendrimer with therapeutic tetrapeptides. Molecular dynamics simulation. AIP Conference Proceedings. 2018. Vol. 1982. pp. 020028.
Хамидова Д.Н., Попова А., Безродный В.В., Михтанюк С.Е., Федотова Е.В., Неелов И.М., Леермакерс Ф. Компьютерное моделирование взаимодействия лизинового дендримера и пептидов эпиталон. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics]. 2018. Т. 18. № 4(116). С. 595-605.
Zhulina E.B., Neelov I.M., Sheiko S.S., Borisov O.V. Planar Brush of End-Tethered Molecular Bottle-Brushes. Scaling Model. Высокомолекулярные соединения. Серия C. 2018. Vol. 60. No. 2. pp. 173-180.
Neelov I.M., Shavykin O.V., Ilyash M.Y., Bezrodnyi V.V., Mikhtaniuk S.E., Darinskii A.A. Comparison of size and other properties of lysine dendrimers and short lysine dendritic brush. Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 2018. Vol. 50. No. 6. pp. 565-565.
Khamidova D.N., Bezrodnyi V.V., Popova A., Mikhtaniuk S.E., Neelov I.M., Popova E.V. Molecular dynamics simulation of complexes of lysine dendrimer and dendrigraft with AENG tetrapeptide. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2018. Vol. 12. pp. 45-58.
Popova E., Bezrodnyi V.V., Neelov I.M. Effect of dendrimer generation on the kinetics of peptide complex formation. Magnetic Resonance and its Applications. SPINUS-2018: abstracts book (15th International Youth School-Conference, Saint Petersburg, November 1-6 April, 2018). 2018. pp. 232-235.
Журавин И.А., Дубровская Н.М., Туманова Н.Л., Васильев Д.С., Тарасенко И.И., Неелов И.М., Наливаева Н.Н. Исследование распространения полилизиновых дендримеров в головном мозге и периферических тканях крыс. Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова [Rossiiskii fiziologicheskii zhurnal imeni I.M. Sechenova]. 2018. Т. 104. № 6. С. 647-653.
Okrugin B.M., Richter R.P., Leermakers F.A., Neelov I.M., Borisov O.V., Zhulina E.B. Structure and properties of polydisperse polyelectrolyte brushes studied by self-consistent field theory. Soft Matter. 2018. Vol. 14. No. 30. pp. 6230-6242.
Dendrimers. Fundamentals and Applications. Cp. 3. Lysine Dendrimers and Their Complexes with Therapeutic and Amyloid Peptides: Computer Simulation / E. Popova, D. Khamidova, I. Neelov, F. Komilov
Effect of dendrimer generation on the kinetics of peptide complex formation
Okrugin B.M., Neelov I.M., Leermakers F.A., Borisov O.V. Structure of asymmetrical peptide dendrimers: Insights given by self-consistent field theory. Polymer. 2017. Vol. 125. pp. 292-302.
Neelov I.M., Popova E.V. Complexes of Lysine Dendrimer of 2nd/3rd Generations and Semax Peptides. Molecular Dynamics Simulation. WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine. 2017. Vol. 14. pp. 75-82.
Neelov I.M., Popova E.V. Molecular Dynamics Simulation of Complex Formation by Lysine Dendrigraft of Second Generation and Semax Peptide. International Journal of Materials. 2017. Vol. 4. No. 1. pp. 16-21.
Федотова Е.В., Хамидова Д.Н., Неелов И.М., Камилов Ф., Леермакерс Ф. Компьютерное моделирование взаимодействия лизиновых дедримеров со стопкой амилоидных пептидов. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics]. 2017. Т. 17. № 6(112). С. 1033–1044.
Neelov I., Popova E. Interaction of Lysine Dendrigraft of 2nd Generation and Semax Peptide. Molecular Dynamics Simulation. International Conference on Control, Artificial Intelligence, Robotics & Optimization (ICCAIRO). 2017. pp. 182-186.
Neelov I.M., Popova E.V., Khamidova D.N., Tarasenko I.I. Complexes of Lysine Dendrimers of 2nd Generation with Semax and Epithalon Peptides. Molecular Dynamics Simulation. International Journal of Biology and Biomedicine. 2017. Vol. 2. pp. 28-33.
Neelov I., Popova E.V. Interaction of Lysine Dendrimer and Semax Peptides. Molecular Dynamics Simulation. International Journal of Biology and Biomedicine. 2017. Vol. 2. pp. 6-12.
Gowdy J., Batchelor M., Neelov I.M., Paci E. Nonexponential Kinetics of Loop Formation in Proteins and Peptides: A Signature of Rugged Free Energy Landscapes?. Journal of Physical Chemistry B. 2017. Vol. 121. No. 41. pp. 9518–9525.
Self-consistent field calculations of micelle consisting of hybrid molecules with dendrimer head and hydrophobic tail
Computer Simulation of the Behavior of Lysine Dendrimers and Dendrigrafts in Different Solvents
Neelov I.M., Popova E.V., Khamidova D., Komilov Ф. Interaction of lysine dendrimers of 2nd and 3rd generation with stack of amyloid peptides. Molecular dynamics simulation. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2017. Vol. 11. pp. 95-100.
Neelov I., Popova E., Khamidova D., Tarasenko I. Interaction of lysine dendrimers with therapeutic peptides. Molecular dynamics simulation. International Journal of Biology and Biomedical Engineering. 2017. Vol. 11. pp. 194-203.
The self-assembly of hybrid molecules consisting of dendrimers and hydrocarbon tails
Investigation of structural characteristics of dendrimers with large branching asymmetry by the Brownian dynamic method
Effect of the side chain length on the conformation of charged homopolypeptides. Molecular dynamics simulation
Исследование структурных характеристик дендримеров с большой асимметрией ветвления методом броуновской динамики
Influence of dendron generation number and salt type and concentration on the self-assembly of hybrid molecules consisting of dendritic head and hydrophobic tail
The sensitivity of local dynamics and its manifistation in NMR to excluded volume in dendrimers
Molecular dynamics simulation of lysine dendrimer of 5th generation and oppositely charged Semax peptides
Effect of the excluded volume interactions in the local dynamics in dendrimers
Neelov I.M., Popova E.N. Molecular Dynamics Simulation of Lysine Dendrimer and Oppositely Charged Semax Peptides. Proceedings - 2016 3rd International Conference on Mathematics and Computers in Sciences and in Industry, MCSI 2016. 2016. pp. 7815123.
Ильяш М.Ю., Округин Б.М., Хамидова Д.Н., Неелов И.М. Молекулярно-динамическое моделирование лизиновых дендримеров и их гибридов с биоактивными пептидами. Евразийский союз ученых (ЕСУ). 2016. № 3-1(24). С. 148-153.
Neelov I.M., Ilyash M.Y., Fal’Kovich S.G., Darinskii A.A. Computer simulation of lysine dendrimers by molecular dynamics method. Synthesis, Characterization and Modelling of Nano-Sized Structures. 2016. pp. 147-156.
Neelov I.M., Попова Е.В., Округин Б.М. Molecular Dynamics Simulation of Interaction of Short Lysine Brush and Oppositely Charged Semax Peptides. Natural Science.. Scientific Research Publishing. 2016. Vol. 8. pp. 499-510.
Computer simulation of lysine dendrimers by molecular dynamics method ( Book Chapter)
Synthesis, Characterization and Modelling of Nano-Sized Structures. Chapter 11. Computer Simulation of Dendronized Polymers. Effect of the Grafts Branching on the Segment Anisotropy of the Backbone / I.V. Michailov, A.A. Darinskii. Chapter 12. Computer Simulation of Lysine Dendrimers by Molecular Dynamics Method / I. Neelov, M. Ilyash, S. Falkovich A. Darinskii
Неелов И.М., Родченко С.В. Определение молекулярно-массовых характеристик звездообразного поли(2-изопропил-2-оксазолина) и исследование его поведения в водном растворе при нагревании. Молодежь в науке: Новые аргументы: сборник научных работ V-го Международного молодежного конкурса (Липецк, 10ноября 2016г.). 2016. Т. Часть 2. С. 185-190.
Безродный В.В., Неелов И.М. Изучение положительно заряженных гомопептидов и их комплексов с противоположно заряженными пептидами методом молекулярной динамики. Альманах научных работ молодых ученых Университета ИТМО. 2016. Т. 1. С. 124-126.
Неелов И.М., Безродный В.В. Моделирование положительно заряженных полипептидов, являющихся гомологами полилизина. Молодежь в науке: Новые агрументы: Сборник научных работ V Международного молодежного конкурса (Липецк, 10ноября 2016г.). 2016. Т. II. С. 176-180.
Хватов А.Ю., Неелов И.М. Моделирование отрицательно заряженных полипептидов и их комплексов с лизиновыми дендримерами. Альманах научных работ молодых ученых Университета ИТМО. 2016. Т. 5. С. 169-171.
Шавыкин О.В., Попова Е.В., Даринский А.А., Неелов И.М., Леермакерс Ф. Компьютерное моделирование методом броуновской динамики локальной подвижности в дендримерах с асимметричным ветвлением. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics]. 2016. Т. 16. № 5(105). С. 893-902.
Shavykin O.V., Neelov I.M., Darinskii A.A. Is the manifestation of the local dynamics in the spin-lattice NMR relaxation in dendrimers sensitive to excluded volume interactions?. Physical Chemistry Chemical Physics. 2016. Vol. 18. No. 35. pp. 24307-24317.
Попова Е.В., Шавыкин О.В., Неелов И.М., Лирмейкерс Ф. Молекулярно-динамическое моделирование взаимодействия лизинового дендримера и пептидов семакс. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics]. 2016. Т. 16. № 4(104). С. 716–724.
Неелов И.М., Хватов А.Ю. Молекулярное моделирование отрицательно заряженных полипептидов, являющихся гомологами полиаспарагиновой кислоты. Молодежь в науке: Новые агрументы: Сборник научных работ V Международного молодежного конкурса (Липецк, 10ноября 2016г.). 2016. Т. II. С. 191-195.
Markelov D.A., Falkovich S.G., Neelov I.M., Ilyash M.Y., Matveev V.V., Lahderanta E., Matveev V.V., Falkovich S., Lahderanta E.M., Ingman P., Darinskii A.A. Molecular dynamics simulation of spin-lattice NMR relaxation in poly-L-lysine dendrimers: Manifestation of the semiflexibility effect. Physical Chemistry Chemical Physics. 2015. Vol. 17. No. 5. pp. 3214-3226.
Неелов И.М., Хамидова Д.Н. Моделирование фрагментов амилоидных фибрилл и их взаимодействия с дендримерами. Молодежь в науке: Новые агрументы: Сборник научных работ II Международного молодежного конкурса (Россия, г. Липецк, 21 октября 2015 г.). 2015. Т. II. С. 79-82.
Основы физики макромолекул
Computer simulation and experimental study of lysine dendrimer influence on formation of fibrils in the multicomponent polyelectrolyte systems
Михайлов И.В., Шавыкин О.В., Даринский А.А., Неелов И.М. Корреляция между размерами и топологическими индексами для ряда сверхразветвленных полимеров. Вестник Тверского государственного университета. Серия: Химия. 2015. № 2. С. 68-87.
Неелов И.М., Хватов А.Ю. Моделирование отрицательно заряженных полипептидов на основе аспарагиновой кислоты (Asp) и ее гомолога Asu. Молодежь в науке: Новые агрументы: Сборник научных работ II Международного молодежного конкурса (Россия, г. Липецк, 21 октября 2015 г.). 2015. Т. II. С. 83-86.
Неелов И.М., Безродный В.В. Молекулярно динамическое моделирование положительно заряженных полипептидов на основе лизина (Lys) и Dap. Молодежь в науке: Новые агрументы: Сборник научных работ II Международного молодежного конкурса (Россия, г. Липецк, 21 октября 2015 г.). 2015. Т. II. С. 32-35.
Ilyash M.Y., Khamidova D.N., Okrugin B.M., Neelov I.M. Computer simulation of lysine dendrimers and their interactions with amyloid peptides. WSEAS Transaction on Biology and Biomedicine. 2015. Vol. 12. pp. 79-86.
Molecular dynamics simulation of lysine dendrigrafts
Modeling of bioresorbable chitin-chitosan nanocomposites, Multifunctional
Structure of Lysine Dendrimers. Molecular Dynamic Simulation.
New branched peptide structures: lysine dendrimers, dendrigrafts and brushes
SCF calculations of symmetric and asymmetric dendrimers
Ilyash M.Y., Markelov D.A., Neelov I.M. Structure of Lysine Dendrimers. Molecular Dynamic Simulation. Mathematical and Computational Methods in Applied Science. 2015. Vol. 51. pp. 155-160.
Lysine dengrigrafts and dendrimers. Structural similarities and differences
Computer simulation of bioresorbable nanocomposite on the base of chitosan and chitin filler
XVII МЕЖДУНАРОДНЫЙ ФОРУМ по проблемам науки, техники и образования "III ТЫСЯЧЕЛЕТИЕ – НОВЫЙ МИР
Введение в молекулярное моделирование биополимеров
Computer simulation of bioresorbable polyelectrolyte complexes on the base of linear and branched peptides
Молекулярно-динамическое моделирование лизиновых дендримеров при различных температурах
Computer simulation of new type of branched peptides- lysine dendrigrafts
. Молекулярно-динамическое моделирование нового типа разветвленных пептидных структур
Neelov I., Ilyash M., Falkovich S., Darinskii A. Computer simulation of lysine dendrimers by molecular dynamics method. Smart Nanocomposites. 2014. Vol. 5. No. 2. pp. 127-132.
Yudin V.E., Dobrovolskaya I.P., Neelov I.M., Dresvyanina E.N., Popryadukhin P.V., Ivan’Kova E.M., Elokhovskii V.Y., Kasatkin I.A., Okrugin B.M., Morganti P. Wet spinning of fibers made of chitosan and chitin nanofibrils. Carbohydrate Polymers. 2014. Vol. 108. No. 1. pp. 176–182.
Неелов И.М., Мистонова А.А., Хватов А.Ю., Безродный В.В. Молекулярно-динамическое моделирование пептидных полиэлектролитов. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics]. 2014. № 4(92). С. 169-175.
Structure-properties relations of polylysine dendrigrafts: experiment and computer simulation data
Моделирование взаимодействия молекул хитина и хитозана в биоресорбируемых композитах
Моделирование методом Монте-Карло функции распределения плотности дисков с 2d смесях жестких анизотропных дископрямоугольников и изотропных дисков
Neelov I.M., Janaszewska A., Klajnert B., Bryszewska M., Makova N.Z., Hicks D.A., Pearson H.A., Vlasov G.P., Ilyash M.Y., Vasilev D.S., Dubrovskaya N.M., Tumanova N.L., Zhuravin I.A., Turner A.J., Nalivaeva N.N. Molecular Properties of Lysine Dendrimers and their Interactions with A beta-Peptides and Neuronal Cells. Current Medicinal Chemistry. 2013. Vol. 20. No. 1. pp. 134-143.
Dendrimers in Biomedical Applications. Chapter 8. Molecular Dynamics of Lysine Dendrimers. Computer Simulation and NMR
Ориентации молекул хитозана наночастицами хитина. Молекулярное моделирование
Компьютерное моделирование структуры гибридных молекулярных систем на основе пептидных дендримеров и нейроактивных пептидов
Компьютерное моделирование взаимодействия пептидных дендримеров и фрагментов амилоидных пептидов и амилоидных протофибрилл
Dendrimers in Biomedical Applications. Chapter 8. Molecular Dynamics of Lysine Dendrimers. Computer Simulation and NMR
Falkovich S.G., Markelov D.A., Neelov I.M., Darinskii A.A. Are structural properties of dendrimers sensitive to the symmetry of branching? Computer simulation of lysine dendrimers. Journal of Chemical Physics. 2013. Vol. 139. No. 6. pp. 064903.
Неелов И.М., Маркелов Д.А., Фалькович С.Г., Ильяш М.Ю., Округин Б.М., Даринский А.А. Математическое моделирование лизиновых дендримеров. Температурные зависимости. Высокомолекулярные соединения. Серия А. 2013. Т. 55. № 7. С. 963-970.
Neelov I.M., Markelov D.A., Falkovich S.G., Ilyash M.Y., Okrugin B.M., Darinskii A.A. Mathematical Simulation of Lysine Dendrimers: Temperature Dependences. Polymer Science - Series C. 2013. Vol. 55. No. 1. pp. 154-161.
Неелов И.М. Молекулярно динамическое моделирование лизиновых дендримеров. Труды XVII Международного Форума по проблемам науки, техники и образования, 10-13 декабря 2013 г., Москва. 2013. С. 116-119.
Molecular Dynamics of Peptide Dendrimers
Изучение размеров кластеров в 2d смесях жестких анизотропных дископрямоугольников и изотропных дисков
Российская Федерация, Санкт-Петербург
Российская Федерация, Санкт-Петербург
Великобритания, Лондон
Италия, Рим
Российская Федерация, Санкт-Петербург
Великобритания
Великобритания
Мальта, Моста
Испания, Барселона
Швейцария, Лугано
Испания, Мадрид