Velichko N.S., Kokoulin M.S., Dmitrenok P.S., Grinev V.S., Kuchur P.D., Komissarov A.S., Fedonenko Y.P. Lipopolysaccharides of Herbaspirillum species and their relevance for bacterium–host interactions. International Journal of Biological Macromolecules. 2024. Vol. 261. No. 1. pp. 129516.
Bakalenko N., Smirnova D., Gaifullina L., Kuchur P., Ian D., Atyukov M., Liu J., Malashicheva A. NOTCH4 is a new player in the development of pulmonary fibrosis. Gene Expression. 2024. Vol. 23. No. 4. pp. 273-281.
Lobov A., Kuchur P.D., Boyarskaya N., Perepletchikova D., Taraskin I., Ivashkin A., Kostina D., Khvorova I., Uspensky V., Repkin E., Denisov E., Gerashchenko T., Tikhilov R., Bozhkova S., Karelkin V., Wang C., Xu K., Malashicheva A. Similar, but not the same: multi-omics comparison of human valve interstitial cells and osteoblast osteogenic differentiation expanded with an estimation of data-dependent and data-independent PASEF. BioRxiv [база препринтов]. 2024.
Lobov A., Kuchur P.D., Khizhina A., Kotova A., Ivashkin A., Kostina D., Klausen P., Khokhlova E., Repkin E., Postnikova K., Perepletchikova D., Denisov E., Gerashchenko T., Tikhilov R., Bozhkova S., Sereda A., Karelkin V., Enukashvily N., Malashicheva A. Mesenchymal cells retain the specificity of embryonal origin during osteogenic differentiation. Stem Cells. 2024. Vol. 42. No. 1. pp. 76-89.
Сравнительная и эволюционная геномика соматических антигенов бактерий семейства Oxalobacteraceae
StemCellBio
Kuchur P.D. Identification and comparison of somatic antigen composition for bacteria from Providencia genus. BioRxiv [база препринтов]. 2022. pp. 1-19.
Пущино / Особенности структуры соматических антигенов патогенных микроорганизмов
Afonnikova S.D., Komissarov A.S., Kuchur P.D. Unique or not unique? Comparative genetic analysis of bacterial O-antigens from the Oxalobacteraceae family [Сравнительный генетический анализ О-антигенов бактерий семейства Oxalobacteraceae: уникальность или тривиальность?]. Вавиловский журнал генетики и селекции = Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 2022. Vol. 26. No. 8. pp. 810-818.
Kuchur O.A., Kuchur P.D., Kuzmina D., Zavirsky A.V., Shtil A. Differential Regulation of BBC3/PUMA and PMAIP1/Noxa in Ionizing Radiation: the Role of p53. Cell and Tissue Biology. 2021. Vol. 15. No. 6. pp. 544-553.
Кучур О.А., Кучур П.Д., Кузьмина Д.О., Завирский А.В., Штиль А.А. Дифференциальная регуляция BBC3/PUMA и PMAIP1/Noxa при ионизирующем излучении: роль p53 [Differential Regulation of BBC3/PUMA and PMAIP1/Noxa by Ionizing Radiation: A Role for p53]. Цитология [Tsitologiya]. 2021. Т. 63. № 4. С. 363-372.
Dukhinova M.S., Kokinos E., Kuchur P.D., Komissarov A., Shtro A. Macrophage-derived cytokines in pneumonia: Linking cellular immunology and genetics. Cytokine and Growth Factor Reviews. 2021. Vol. 59. pp. 46-61.
GINOFIP-пайплайн для поиска оперонов с генами интереса
Сравнительная геномика соматических антигенов симбиотических и условно-патогенных бактерий рода Herbaspirillum
Усовершенствование GINOFIP – алгоритма для идентификации оперонов интереса. Сборник тезисов XXI Всероссийской конференции молодых ученых «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии»
Identification and comparison of somatic antigen structures of symbiotic and pathogenic bacteria from Morganellaceae family
Automatic annotation of operons responsible for O-antigen synthesis
Velichko N.S., Kokoulin M.S., Sigida E.N., Kuchur P.D., Komissarov A.S., Kovtunov E.A., Fedonenko Y.P. Structural and genetic characterization of the colitose-containing O-specific polysaccharide from the lipopolysaccharide of Herbaspirillum frisingense GSF30T. International Journal of Biological Macromolecules. 2020. Vol. 161. pp. 891-897.
Comparative genomics analysis of o-antigen related genes in prokaryotic genomes
Особенности структурной организации оперонов О-антигена в геноме Herbaspirillum frisingense
Влияние человеческого фактора на результативность генетических исследований в рамках прогнозирования атеросклероза
Создание пайплайна для автоматизации поиска О-антигена грамотрицательных бактерий
Анализ генов, отвечающих за синтез соматического антигена в геномах бактерий
Rayko M., Komissarov A.S., Kwan J., Lim-Fong G., Rhodes A., Kliver S., Kuchur P.D., O’Brien S., Lopez J. Draft genome of Bugula neritina, a colonial animal packing powerful symbionts and potential medicines. Scientific Data. 2020. Vol. 7. No. 1. pp. 356.
Российская Федерация
Российская Федерация, Санкт-Петербург