Это неправильные пчелы: предсказание патогенов пчел по физическим характеристикам улья с помощью bee-ИИ
Они делают неправильный мед: патологическая метагеномика пчелиного улья
Serdiukov A., Dravgelis V., Smutin D., Taldaev A., Ivanov A., Adonin L., Muravyov S. Efficient and Verified Research Data Extraction with LLM. Algorithms. 2026. Vol. 19. No. 3. pp. 214.. doi: 10.3390/a19030214
Сезонные ритмы микробиома медоносной пчелы apis mellifera. Метаанализ на основе открытых данных
Рнк-опосредованные взаимодействия: алгоритм поиска мишеней eRNAi для изучения влияния метагенома
Асадуллин А.Ф., Кащенко Г.А., Клочев А.С., Тальдаев А.Х., Смутин Д.В., Адонин Л.С. Цифровой метаанализ источников и путей передачи микробиоты Apis mellifera L.: применение методов биоинформатики для анализа 16S-секвенирования. Вестник СПбГУТ. 2025. Т. 3. № 3. С. 5.
ВИРУС AMFV - АГЕНТ ФОРМИРОВАНИЯ СОЦИАЛЬНОГО ИММУНИТЕТА МЕДОНОСНОЙ ПЧЕЛЫ
ПОЛНЫЙ МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА РАСПЛОДНЫХ СОТ APIS MELLIFERA
Smutin D.V., Ishtuganova V., Kravchenko M. DEVELOPMENT OF AN ALGORITHM TO SEARCH FOR ERNAI TARGETS USING MULTI-OMICS ANALYSIS DATA. BIOINFORMATICS INSTITUTE 2024/25. 2025. pp. 30-32.
Lebedev E., Smutin D., Timkin P., Kotelnikov D., Taldaev A., Panushev N., Adonin L. The eusocial non-code: Unveiling the impact of noncoding RNAs on Hymenoptera eusocial evolution. Non-coding RNA Research. 2025. Vol. 11. pp. 48-59.. doi: 10.1016/j.ncrna.2024.10.007
Asadullin A., Kashchenko G., Klochev A., Taldaev A., Adonin L., Smutin D. Meta-analysis of sources and transmission pathways of Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) microbiota based on 16S sequencing data. Journal of Insect Science. 2025. Vol. 25. No. 6. pp. ieaf093.. doi: 10.1093/jisesa/ieaf093
Kashchenko G., Taldaev A., Adonin L., Smutin D. Investigating Aerobic Hive Microflora: Role of Surface Microbiome of Apis Mellifera. Biology. 2025. Vol. 14. No. 1. pp. 88.. doi: 10.3390/biology14010088
SAMOVA.R: АВТОМАТИЧЕСКИЙ БЕНЧМАРКИНГ МЕТАГЕНОМНЫХ ПРОГРАММ НА СГЕНЕРИРОВАННЫХ ДАННЫХ
Маркова Н.А., Тальдаев А.Х., Придворов Г.В., Смутин Д.В., Адонин Л.С., Слижов П.А., Ганапольский В.П., Глушаков Р.И. Поиск потенциальных мишеней амтизола методами in silico [Search for potential targets of amtizol by in silico methods]. Экспериментальная и клиническая фармакология [Eksperimental'naya i Klinicheskaya Farmakologiya]. 2025. Т. 88. № 12. С. 31-38.. doi: 10.30906/0869-2092-2025-88-12-31-38
МИКРОБИОМЫ УЛЬЯ: БОЛЬШЕ, ЧЕМ СУПЕРОРГАНИЗМ
Враг моего врага - мой друг: метаанализ метагеномов в поисках нативной биозащиты пчелиного улья
Маркова Н.А., Тальдаев А.Х., Придворов Г.В., Смутин Д.В., Адонин Л.С., Слижов П.А., Ганапольский В.П., Глушаков Р.И. Поиск потенциальных мишеней амтизола методами in silico. Экспериментальная и клиническая фармакология. 2025.. doi: 10.30906/0869-2092-2025-88-12-31-38
ПЧЕЛИНЫЙ МИКРОБИОМ: НЕВИДИМАЯ СИЛА, ПОДДЕРЖИВАЮЩАЯ ЖИЗНЬ
Молекулярные аспекты дифференциации каст у пчел: мета-анализ данных scRNAseq
Взаимосвязь между микроорганизмами в составе метагенома ячеек улья.
Как функционируют метагеномы в едином суперорганизме улья?
Метагеномы ячеек личинок и куколок медоносной пчелы Apis mellifera
Samovar: библиотека для генерации метагеномов с заданными свойствами
Метагеномы пчелиного улья: как функционирует “общий” геном пчелиного улья
Метагеномы пчелиного улья: как функционирует “общий” геном пчелиного улья.
Полный геном пчелиного улья: функции и пути передачи микроорганизмов
Геном “суперорганизма” пчел: взаимосвязь между метагеномами улья Apis mellifera
Взаимосвязь между микроорганизмами в составе метагеномов улья
Смутин Д.В. Вирус AMFV – агент формирования социального иммунитета медоносной пчелы. Биотехнология [Biotekhnologiya]. 2024. Т. 40. № 7. С. 112.. doi: 10.56304/S0234275824070603
Тальдаев А.Х., Смутин Д.В. Полный метагеномный анализ микробиома расплодных сот apis mellifera. Биотехнология [Biotekhnologiya]. 2024. Т. 40. № 7. С. 229.. doi: 10.56304/S0234275824071487
Смутин Д.В. Микробиомы улья: больше, чем суперорганизм. Биотехнология [Biotekhnologiya]. 2024. Т. 40. № 7. С. 227.. doi: 10.56304/S023427582407144X
Смутин Д.В. Метагеномы пчел: как функционирует «общий» геном пчелиного улья.. ООО Издательский дом "Петрополис". 2024. С. 106.
Smutin D., Taldaev A., Lebedev E., Adonin L. Shotgun Metagenomics Reveals Minor Micro“bee”omes Diversity Defining Differences between Larvae and Pupae Brood Combs. International Journal of Molecular Sciences. 2024. Vol. 25. No. 2. pp. 741.. doi: 10.3390/ijms25020741
Метагеном ячеек улья: постоянство на фоне функциональных различий в минорном разнообразии между личинками и куколками
Метагеном ячеек улья: постоянство на фоне функциональных различий в минорном разнообразии между личинками и куколками
Оценка микробиома ульев медоносной пчелы
Лебедев Е., Смутин Д.В., Тальдаев А.Х., Адонин Л.С. Оценка миркобиома ячеек ульев медоносной пчелы. От микробиологии к генетическим технологиям: материалы всероссийской конференции (Новосибирск, 22–25 сентября 2023 г.). 2023. С. 146-147.
Изменения микро”bee”ома ячеек улья в ходе индивидуального развития эмбрионов медоносной пчелы Apis mellifera.
Smutin D., Lebedev E., Selitskiy M., Panyushev N., Adonin L. Micro”bee”ota: Honey Bee Normal Microbiota as a Part of Superorganism. Microorganisms. 2022. Vol. 10. No. 12. pp. 2359.. doi: 10.3390/microorganisms10122359
Maltseva A.L., Stepanova M.A., Varfolomeeva M.A., Vikhreva D.V., Smutin D.V., Pavlova P.A., Maslakov G.P., Danilov L., Mikhailova N.A., Granovitch A.I. Phylogeography of the closely related Littorina (Neritrema) species in the North-East Atlantic. Invertebrate Zoology. 2022. Vol. 19. No. 4. pp. 404-424.. doi: 10.15298/invertzool.19.4.05