Они делают неправильный мед: патологическая метагеномика пчелиного улья
Это неправильные пчелы: предсказание патогенов пчел по физическим характеристикам улья с помощью bee-ИИ
Serdiukov A., Dravgelis V., Smutin D., Taldaev A., Ivanov A., Adonin L., Muravyov S. Efficient and Verified Research Data Extraction with LLM. Algorithms. 2026. Vol. 19. No. 3. pp. 214.. doi: 10.3390/a19030214
Маркова Н.А., Тальдаев А.Х., Придворов Г.В., Смутин Д.В., Адонин Л.С., Слижов П.А., Ганапольский В.П., Глушаков Р.И. Поиск потенциальных мишеней амтизола методами in silico. Экспериментальная и клиническая фармакология. 2025.. doi: 10.30906/0869-2092-2025-88-12-31-38
Маркова Н.А., Тальдаев А.Х., Придворов Г.В., Смутин Д.В., Адонин Л.С., Слижов П.А., Ганапольский В.П., Глушаков Р.И. Поиск потенциальных мишеней амтизола методами in silico [Search for potential targets of amtizol by in silico methods]. Экспериментальная и клиническая фармакология [Eksperimental'naya i Klinicheskaya Farmakologiya]. 2025. Т. 88. № 12. С. 31-38.. doi: 10.30906/0869-2092-2025-88-12-31-38
SAMOVA.R: АВТОМАТИЧЕСКИЙ БЕНЧМАРКИНГ МЕТАГЕНОМНЫХ ПРОГРАММ НА СГЕНЕРИРОВАННЫХ ДАННЫХ
Молекулярные аспекты дифференциации каст у пчел: мета-анализ данных scRNAseq
Враг моего врага - мой друг: метаанализ метагеномов в поисках нативной биозащиты пчелиного улья
Сезонные ритмы микробиома медоносной пчелы apis mellifera. Метаанализ на основе открытых данных
Рнк-опосредованные взаимодействия: алгоритм поиска мишеней eRNAi для изучения влияния метагенома
МИКРОБИОМЫ УЛЬЯ: БОЛЬШЕ, ЧЕМ СУПЕРОРГАНИЗМ
Асадуллин А.Ф., Кащенко Г.А., Клочев А.С., Тальдаев А.Х., Смутин Д.В., Адонин Л.С. Цифровой метаанализ источников и путей передачи микробиоты Apis mellifera L.: применение методов биоинформатики для анализа 16S-секвенирования. Вестник СПбГУТ. 2025. Т. 3. № 3. С. 5.
Smutin D.V., Ishtuganova V., Kravchenko M. DEVELOPMENT OF AN ALGORITHM TO SEARCH FOR ERNAI TARGETS USING MULTI-OMICS ANALYSIS DATA. BIOINFORMATICS INSTITUTE 2024/25. 2025. pp. 30-32.
Asadullin A., Kashchenko G., Klochev A., Taldaev A., Adonin L., Smutin D. Meta-analysis of sources and transmission pathways of Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) microbiota based on 16S sequencing data. Journal of Insect Science. 2025. Vol. 25. No. 6. pp. ieaf093.. doi: 10.1093/jisesa/ieaf093
ПОЛНЫЙ МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ МИКРОБИОМА РАСПЛОДНЫХ СОТ APIS MELLIFERA
ВИРУС AMFV - АГЕНТ ФОРМИРОВАНИЯ СОЦИАЛЬНОГО ИММУНИТЕТА МЕДОНОСНОЙ ПЧЕЛЫ
ПЧЕЛИНЫЙ МИКРОБИОМ: НЕВИДИМАЯ СИЛА, ПОДДЕРЖИВАЮЩАЯ ЖИЗНЬ
Kashchenko G., Taldaev A., Adonin L., Smutin D. Investigating Aerobic Hive Microflora: Role of Surface Microbiome of Apis Mellifera. Biology. 2025. Vol. 14. No. 1. pp. 88.. doi: 10.3390/biology14010088
Lebedev E., Smutin D., Timkin P., Kotelnikov D., Taldaev A., Panushev N., Adonin L. The eusocial non-code: Unveiling the impact of noncoding RNAs on Hymenoptera eusocial evolution. Non-coding RNA Research. 2025. Vol. 11. pp. 48-59.. doi: 10.1016/j.ncrna.2024.10.007
Смутин Д.В. Вирус AMFV – агент формирования социального иммунитета медоносной пчелы. Биотехнология [Biotekhnologiya]. 2024. Т. 40. № 7. С. 112.. doi: 10.56304/S0234275824070603
Полный геном пчелиного улья: функции и пути передачи микроорганизмов
Смутин Д.В. Микробиомы улья: больше, чем суперорганизм. Биотехнология [Biotekhnologiya]. 2024. Т. 40. № 7. С. 227.. doi: 10.56304/S023427582407144X
Метагеном ячеек улья: постоянство на фоне функциональных различий в минорном разнообразии между личинками и куколками
Тальдаев А.Х., Смутин Д.В. Полный метагеномный анализ микробиома расплодных сот apis mellifera. Биотехнология [Biotekhnologiya]. 2024. Т. 40. № 7. С. 229.. doi: 10.56304/S0234275824071487
Смутин Д.В. Метагеномы пчел: как функционирует «общий» геном пчелиного улья.. ООО Издательский дом "Петрополис". 2024. С. 106.
Взаимосвязь между микроорганизмами в составе метагеномов улья
Геном “суперорганизма” пчел: взаимосвязь между метагеномами улья Apis mellifera
Метагеном ячеек улья: постоянство на фоне функциональных различий в минорном разнообразии между личинками и куколками
Samovar: библиотека для генерации метагеномов с заданными свойствами
Взаимосвязь между микроорганизмами в составе метагенома ячеек улья.
Smutin D., Taldaev A., Lebedev E., Adonin L. Shotgun Metagenomics Reveals Minor Micro“bee”omes Diversity Defining Differences between Larvae and Pupae Brood Combs. International Journal of Molecular Sciences. 2024. Vol. 25. No. 2. pp. 741.. doi: 10.3390/ijms25020741
Как функционируют метагеномы в едином суперорганизме улья?
Метагеномы пчелиного улья: как функционирует “общий” геном пчелиного улья
Метагеномы ячеек личинок и куколок медоносной пчелы Apis mellifera
Метагеномы пчелиного улья: как функционирует “общий” геном пчелиного улья.
Оценка микробиома ульев медоносной пчелы
Изменения микро”bee”ома ячеек улья в ходе индивидуального развития эмбрионов медоносной пчелы Apis mellifera.
Лебедев Е., Смутин Д.В., Тальдаев А.Х., Адонин Л.С. Оценка миркобиома ячеек ульев медоносной пчелы. От микробиологии к генетическим технологиям: материалы всероссийской конференции (Новосибирск, 22–25 сентября 2023 г.). 2023. С. 146-147.
Smutin D., Lebedev E., Selitskiy M., Panyushev N., Adonin L. Micro”bee”ota: Honey Bee Normal Microbiota as a Part of Superorganism. Microorganisms. 2022. Vol. 10. No. 12. pp. 2359.. doi: 10.3390/microorganisms10122359
Maltseva A.L., Stepanova M.A., Varfolomeeva M.A., Vikhreva D.V., Smutin D.V., Pavlova P.A., Maslakov G.P., Danilov L., Mikhailova N.A., Granovitch A.I. Phylogeography of the closely related Littorina (Neritrema) species in the North-East Atlantic. Invertebrate Zoology. 2022. Vol. 19. No. 4. pp. 404-424.. doi: 10.15298/invertzool.19.4.05