Лобода Александр Александрович

Лобода Александр Александрович
кандидат технических наук
ассистент (квалификационная категория "ассистент"), факультет информационных технологий и программирования

Преподаваемые дисциплины в текущем учебном году

  • Методы оптимизации
  • Оптимизация и сэмплирование / Optimization and Sampling

Педагогический стаж

Общий стаж:
6 лет

Публикации

17
Статья
2024 год

Artomov M., Loboda A.A., Artyomov M.N., Daly M.J. Public platform with 39,472 exome control samples enables association studies without genotype sharing. Nature Genetics. 2024. Vol. 56. No. 2. pp. 327-335.

Статья
2023 год

Atkinson E., Artomov M., Loboda A.A., Rehm H., Macarthur D., Karczewski K.J., Neale B.M., Daly M.J. Discordant calls across genotype discovery approaches elucidate variants with systematic errors. Genome Research. 2023. Vol. 33. No. 6. pp. 999-1005.

Статья
2023 год

Pinakhina D., Loboda A., Sergushichev A., Artomov M. Gene, cell type, and drug prioritization analysis suggest genetic basis for the utility of diuretics in treating Alzheimer disease. Human Genetics and Genomics Advances. 2023. Vol. 4. No. 3. pp. 100203.

Статья
2022 год

Kolosov N., Rezapova V., Rotar O., Loboda A., Freylikhman O., Melnik O., Sergushichev A., Stevens C., Voortman T., Kostareva A., Konradi A., Daly M., Artomov M. Genotype imputation and polygenic score estimation in northwestern Russian population. PLoS ONE. 2022. Vol. 17. No. 6. pp. e0269434.

Статья
2022 год

Emelianova M., Gainullina A., Poperechnyi N., Loboda A.A., Artyomov M., Sergushichev A. Shiny GATOM: omics-based identification of regulated metabolic modules in atom transition networks. Nucleic Acids Research. 2022. Vol. 50. No. 1. pp. W690-W696.

Статья
2022 год

Nehme R., Pietilainen O., Artomov M., Tegtmeyer M., Valakh V., Lehtonen L., Bell C., Singh T., Trehan A., Sherwood J., Manning D., Peirent E., Malik R., Guss E., Hawes D., Beccard A., Bara A., Hazelbaker D., Zuccaro E., Genovese G., Loboda A.A., Neumann A., Lilliehook C., Kuismin O., Hamalainen E., Kurki M., Hultman C., Kahler A., Paulo J., Ganna A., Madison J., Cohen B., Mcphie D., Adolfsson R., Perlis R., Dolmetsch R., Farhi S., Mccarroll S., Hyman S., Neale B., Barrett L., Harper W., Palotie A., Daly M., Eggan K. The 22q11.2 region regulates presynaptic gene-products linked to schizophrenia. Nature Communications. 2022. Vol. 13. No. 1. pp. 3690.

Тезисы
2022 год

A platform for case-control matching enables association studies without genotype sharing

Тезисы
2021 год

Polygenic Risk Score Estimation in North-Western Russian Population

Статья
2020 год

Лобода А.А., Сергушичев А.А. Вывод генных регуляторных сетей по данным экспрессии генов при помощи байесовских сетей [Inferring of regulatory networks from expression data using bayesian networks]. Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики [Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics]. 2020. Т. 20. № 6(130). С. 835-840.

Статья
2019 год

Artomov M., Loboda A.A., Artyomov M., Daly M. A platform for case-control matching enables association studies without genotype sharing. BioRxiv [база препринтов]. 2019. pp. 1-26.

Тезисы
2019 год

Algorithm for gene regulatory network inference recovers biological insights from large-scale gene expression data (Abstract/Program #1426). Presented at the 69th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics, October 18, Houston.

Тезисы
2019 год

Public platform with 42,291 exome control samples enables association studies without genotype sharing (Abstract/Program #98). Presented at the 69th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics, October 17, Houston.

Тезисы
2018 год

Определение структуры генной регуляторной сети по профилям экспрессии генов

Статья
2017 год

Isomurodov J.E., Loboda A.A., Sergushichev A.A. Ranking Vertices for Active Module Recovery Problem. Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics). 2017. Vol. 10252. pp. 75-84.

Статья
2017 год

Ulland T.K., Song W., Huang S.C., Ulrich J.D., Sergushichev A.A., Beatty W.L., Loboda A.A., Zhou Y., Cairns N.J., Kambal A., Loginicheva E., Gilfillan S., Cella M., Virgin H.W., Unanue E.R., Wang Y., Artyomov M.N., Holtzman D.M., Colonna M. TREM2 Maintains Microglial Metabolic Fitness in Alzheimer's Disease. Cell. 2017. Vol. 170. No. 4. pp. 649-663.e13.

Статья
2016 год

Sergushichev A.A., Loboda A.A., Jha A.K., Vincent E.E., Driggers E.M., Jones R.G., Pearce E.J., Artyomov M.N. GAM: a web-service for integrated transcriptional and metabolic network analysis. Nucleic Acids Research. 2016. Vol. 44. No. 1. pp. W194-W200.

Статья
2016 год

Loboda A.A., Artyomov M.N., Sergushichev A.A. Solving generalized maximum-weight connected subgraph problem for network enrichment analysis. Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics). 2016. Vol. 9838. pp. 210-221.

Повышение квалификации

Повышение квалификации
2023 год
Организация и поддержка образовательного процесса в цифровой образовательной среде

Российская Федерация, Санкт-Петербург