Эльдиб Ахмед Абделкадер Мохамед Отман

Эльдиб Ахмед Абделкадер Мохамед Отман
ассистент (квалификационная категория "ассистент"), химико-биологический кластер

Преподаваемые дисциплины в текущем учебном году

  • Молекулярная биоробототехника / Molecular Biorobotics
  • Принципы работы и приложения олигонуклеотидных биосенсоров / Principles and applications of oligonucleotide biosensors
  • Биосенсоры и их применение для обнаружения и анализа биомаркеров / Biosensors and their applications for biomarker detection and analysis

Педагогический стаж

Общий стаж:
3 года

Публикации

63
Статья
2024 год

Dubovichenko M.V., Nnanyereugo V., Bobkov G.A., El-Deeb A.A., Kolpashchikov D.M. COMPARISON OF ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES, DNAZYMES AND THEIR BIVALENT FORMS IN RNASE H DEPENDENT CLEAVAGE OF FOLDED RNA. не указано. 2024. Vol. не указан. No. не указан. pp. in press.

Статья
2024 год

Dubovichenko M.V., Nedorezova D.D., Patra C., Drozd V.S., Andrianov V.S., Ashmarova A.I., Nnanyereugo V., El-Deeb A.A., Kolpashchikov D.M. Marker-dependent cleavage of RNA by binary (split) DNAzyme (BiDz) and binary DNA machines (BiDNM). ChemBioChem. 2024. No. in press. pp. e202400665.

Тезисы
2024 год

Antisense Oligonucleotides-Mediated Gene Silencing for Cancer Therapy

Тезисы
2024 год

Ultrasensitive-selective DNA nanomachine for Teaticular Germ Cell Tumors detection

Тезисы
2024 год

DESIGN AND DEVELOPMENT OF MARKER ACTIVATED NANOMACHINES USING DNA ORIGAMI FOR CANCER THERAPY

Тезисы
2024 год

OPTIMIZATION OF AFFINITY AND STABILITY OF SELECTED APTAMER FOR BSA

Тезисы
2024 год

Selective DNA-machine for SNP Detection in KRAS

Статья
2024 год

Nedorezova D.D., Dubovichenko M.V., Kalnin A.Y., Nour M.A., Eldeeb A.A., Ashmarova A.I., Kurbanov G.F., Kolpashchikov D.M. Cleaving Folded RNA with DNAzyme Agents. ChemBioChem. 2024. Vol. 25. No. 1. pp. e202300637.

Статья
2024 год

Patra C.K., Smirnov V.V., Drozd V.S., Hussein Z., Rybalko D.S., Kozlova A.V., Nour M., Zemerova T.P., Kolosova O.S., Kalnin A.Y., El-Deeb A. Towards the Development of a DNA Automaton: Modular RNA-cleaving Deoxyribozyme Logic Gates Regulated by miRNAs. Analyst. 2024. Vol. 149. No. 6. pp. 1947-1957.

Статья
2024 год

Nour M., Drozd V.S., Lemeshko E.A., Tafran L., Salimova A.A., Kulikova A.V., Eldeeb A.A. RNase H-dependent DNA thresholder modulated by cancer marker concentration. Chemical Communications. 2024. Vol. 60. No. 33. pp. 4427-4430.

Статья
2024 год

Hussein Z., Golovina L.A., Alaji M., Nour M., Kolpashchikov D.M., Komissarov A.B., El-Deeb A. Enhancing Sensitivity in Nucleic Acid Detection via Collaborative Multiple Catalytic Cores in DNAzyme Nanomachines. ChemBioChem. 2024. No. in press. pp. e202400572.

Статья
2024 год

Dubovichenko M.V., Batsa M., Bobkov G.A., Vlasov G.S., El-Deeb A.A., Kolpashchikov D.M. Multivalent DNAzyme agents for cleaving folded RNA. Nucleic Acids Research. 2024. Vol. 52. No. 10. pp. 5866–5879.

Статья
2024 год

Nedorezova D.D., Dubovichenko M.V., Eldeeb A.A., Nur M.A., Bobkov G.A., Ashmarova A.I., Kalnin A.J., Kolpashchikov D.M. Cleaving Folded RNA by Multifunctional DNAzyme Nanomachines. Chemistry - A European Journal. 2024. Vol. 30. No. 40. pp. e202401580.

Тезисы
2023 год

ADVANCING DNA AUTOMATION: MIRNAS-REGULATED “NOT-GATE” LOGIC ELEMENTS BASED ON DEOXYRIBOZYME DNA MACHINES

Тезисы
2023 год

DEPENDENCE OF THE AFFINITY OF OLIGONUCLEOTIDES ON CHEMICAL MODIFICATIONS AND THE LENGTH OF NUCLEOTIDE SEQUENCES

Тезисы
2023 год

Development of DNA-based Machines for Selective Detection of Cancer-associated RNA

Статья
2023 год

Nour M.A., Kulikova A.V., Wanjohi J., El-Deeb A. Distinguishing High from Low Concentrations of RNA Cancer Marker: Five-Input DNAzyme Thresholding Gate. ChemistrySelect. 2023. Vol. 8. No. 48. pp. e202303011.

Тезисы
2023 год

Genotyping of Cancer-associated KRAS Mutation by Deoxyribozyme Based 4-arms DNA Machine

Тезисы
2023 год

Prospects of using binary deoxyribozymes as a biosensor for quantitative analysis of oligonucleotide concentrations

Тезисы
2023 год

ДНК-МАШИНА С НЕСКОЛЬКИМИ КАТАЛИТИЧЕСКИМИ ЦЕНТРАМИ НА ОСНОВЕ ДЕЗОКСИРИБОЗИМА ДЛЯ БЕЗАМПЛИФИКАЦИОННОГО ДЕТЕКТИРОВАНИЯ SARS-COV-2

Тезисы
2023 год

АКТИВАЦИЯ БИНАРНЫМИ АНТИСМЫСЛОВЫМИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДАМИ ДЕГРАДАЦИИ МРНК-МИШЕНИ С ПОМОЩЬЮ KRAS ТРАНСКРИПТА В КЛЕТОЧНОЙ ЛИНИИ K562 *

Тезисы
2023 год

ГИБЕЛЬ КЛЕТОК АДЕНОКАРЦИНОМЫ ЯИЧНИКА ПОД ВОЗДЕЙСТВИЕМ АНТИСМЫСЛОВЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ

Тезисы
2023 год

MULTICORE DNA-MACHINE BASED ON BINARY DEOXYRIBOZYME FOR AMPLIFICATION-FREE DETECTION OF SARS-COV-2

Тезисы
2023 год

Cancer cell death induced by antisense oligonucletides

Тезисы
2023 год

Использование триазиниламидофосфата для внутриклеточной доставки АСО и сложных ДНК-конструкций//OpenBio

Тезисы
2023 год

Development and optimization of high affinity oncogene-specific DNA aptamers for human cancer cells binding

Тезисы
2023 год

ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES RELEASING CASSETTE FOR CANCER THERAPY

Статья
2023 год

Hussein Z., Nour M., Kozlova A.V., Kolpashchikov D.M., Komissarov A., El-Deeb A. DNAzyme Nanomachine with Fluorogenic Substrate Delivery Function: Advancing Sensitivity in Nucleic Acid Detection. Analytical Chemistry. 2023. Vol. 95. No. 51. pp. 18667-18672.

Тезисы
2023 год

Towards DNA-robot for Auto Diagnosis and Cancer Treatment

Тезисы
2023 год

РАЗРАБОТКА МОДИФИЦИРОВАННОГО БИНАРНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО НУКЛЕОТИДА ДЛЯ РАСЩЕПЛЕНИЯ ЦЕЛЕВОЙ мРНК В ПРИСУТСТВИИ ОНКОМАРКЕРА

Тезисы
2023 год

МНОГОЯДЕРНАЯ ДНК-МАШИНА НА ОСНОВЕ БИНАРНЫХ ДЕЗОКСИРИБОЗИМОВ ДЛЯ БЕЗАМПЛИФИКАЦИОННОЙ ДЕТЕКЦИИ SARS-COV-2

Статья
2023 год

Patra C., Eldeeb A.A. Thresholding DNA nanomachine as a highly cooperative and efficient enzyme-like system for controlled RNA cleavage. ChemMedChem. 2023. Vol. 18. No. 7. pp. e202300040.

Тезисы
2023 год

ДНК-МАШИНЫ НА ОСНОВЕ БИНАРНЫХ ДЕЗОКСИРИБОЗИМОВ КАК ПЕРСПЕКТИВНЫЙ ИНСТРУМЕНТ БЕЗАМПЛИФИКАЦИОННОЙ ДИАГНОСТИКИ SARS-CoV-2

Тезисы
2023 год

РАЗРАБОТКА СЕЛЕКТИВНОЙ ДНК КОНСТРУКЦИИ С ПОРОГОВОЙ ЛОГИКОЙ ДЛЯ РАСЩЕПЛЕНИЯ МАТРИЧНОЙ РНК GFP

Тезисы
2022 год

MARKER INDUCED CLEAVAGE OF A TARGETED mRNA USING THE ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE-RELEASING CASSETTE (ASO-RC)

Тезисы
2022 год

РАЗРАБОТКА ЛОГИЧЕСКОГО ВЕНТИЛЯ «INHIBIT GATE» НА ОСНОВЕ БИНАРНОГО ДЕЗОКСИРИБОЗИМА

Тезисы
2022 год

DESIGN OF A DNA MACHINE BASED ON SHRNA FOR MARKER-DEPENDENT RNA INTERFERENCE

Тезисы
2022 год

ИССЛЕДОВАНИЕ БИНАРНЫХ АНТИСМЫСЛОВЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ СПЕЦИФИЧНЫХ К ОДНОНУКЛЕОТИДНОМУ ПОЛИМОРФИЗМУ МАРКЕРНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Тезисы
2022 год

Binary antisense constructs modulated by the concentration of cancer markers

Тезисы
2022 год

INVESTIGATION OF INTRACELLULAR DELIVERY OF THERAPEUTIC NUCLEIC ACIDS WITH THE HELP OF LIPID CONJUGATES AND DNA NANOSTRUCTURES

Статья
2022 год

Drozd V.S., Eldeeb A.A., Kolpashchikov D.M., Nedorezova D.D. Binary antisense oligonucleotide agent for cancer marker-dependent degradation of targeted RNA. Nucleic Acid Therapeutics. 2022. Vol. 32. No. 5. pp. 412-420.

Статья
2022 год

El-Deeb A., Zablotskaya S., Rubel M.S., Nour M., Kozlovskaya L., Shtro A., Komissarov A., Kolpashchikov D.M. Toward a Home Test for COVID-19 Diagnosis: DNA Machine for Amplification-Free SARS-CoV-2 Detection in Clinical Samples. ChemMedChem. 2022. Vol. 17. No. 20. pp. e202200382.

Статья
2022 год

Rubel M.S., Zablotskay S., Pokatova O., El-Deeb A.A., Ateiah M.G., Gorbenko D.A., Shkodenko L., Kolpashchikov D.M. DNA-nanomachines for nucleic acid detection. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) Novosibirsk, 04-08 июля 2022 г.. 2022. pp. 355-356.

Тезисы
2022 год

КОНСТРУКЦИИ НА ОСНОВЕ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ ДЛЯ ШИРОКОГО СПЕКТРА ПРИМЕНЕНИЙ

Тезисы
2022 год

ДНК МАШИНА С НЕСКОЛЬКИМИ КАТАЛИТИЧЕСКИМИ ЦЕНТРАМИ НА ОСНОВЕ ДЕЗОКСИРИБОЗИМА ДЛЯ БЕЗАМПЛИФИКАЦИОННОЙ ДЕТЕКЦИИ SARS-COV-2

Тезисы
2022 год

DETECTION OF NUCLEIC ACID BASED CANCER MARKERS INSIDE THE CELL

Тезисы
2022 год

ANTENNA-EQUIPPED DEOXYRIBOZYME-BASED DNA MACHINE FOR ULTRA -SENSITIVITY DETECTION OF SARS-COV-2 RNA

Тезисы
2022 год

NUCLEIC ACID BASED CONSTRUCTIONS FOR WIDE RANGE OF APPLICATIONS

Тезисы
2022 год

AN shRNA RELEASING DNA NANOSTRUCTURE WITH ONCOMARKER-DEPENDENT ACTIVATION

Тезисы
2022 год

ОСОБЕННОСТИ ДИЗАЙНА БИНАРНЫХ АНТИСМЫСЛОВЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ АГЕНТОВ (БИАСО) ДЛЯ МАРКЕР-ЗАВИСИМОЙ АКТИВАЦИИ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОЙ ФУНКЦИИ

Тезисы
2022 год

ANTENNA-EQUIPPED DEOXYRIBOZYME MACHINE FOR ULTRA-SENSITIVITY AMPLIFICATION-FREE DETECTION OF SARS-COV-2 RNA

Тезисы
2021 год

DNA Machine for SARS-COV-2 Detection in the Clinical Samples

Тезисы
2021 год

COOPERATIVITY FOR CANCER TREATMENT: A THRESHOLDING DNA LOGIC GATE THAT IS ACTIVE AT HIGH CONCENTRATIONS OF CANCER MARKER RNA

Тезисы
2021 год

ADVANCED DNA MACHINE FOR THE AMPLIFICATION FREE DETECTION OF SARS-HCOV-2 IN THE CLINICAL SAMPLES

Тезисы
2021 год

DEVELOPMENT OF PROTECTIONS FOR ANTISENSE AND BINARY ANTISENSE AGENTS

Тезисы
2021 год

BINARY ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES FOR ONCOMARKER-DEPENDENT TARGET RNA DEGRADATION

Тезисы
2021 год

DISTINGUISHING HIGH FROM LOW CONCENTRATIONS OF RNA CANCER MARKER: 5-INPUT BINARY DEOXYRIBOZYME THRESHOLDING GATE

Статья
2021 год

Gomes de Oliveira A., Dubovichenko M.V., Eldeeb A.A., Wanjohi J., Zablotskaya S., Kolpashchikov D.M. RNA-Cleaving DNA Thresholder Controlled by Concentrations of miRNA Cancer Marker. ChemBioChem. 2021. Vol. 22. No. 10. pp. 1750-1754.

Тезисы
2021 год

DNA-constructs based on binary antisense technology towards selective gene therapy

Тезисы
2021 год

DNA-constructs based on binary antisense technology towards selective gene therapy

Статья
2020 год

Эльдиб А.А., Заблоцкая С.С., Рубель М.С., Комиссаров А.Б., Колпащиков Д.М. ДНК-машина для определения nCOV-SARS-2019. Современные достижения химико-биологических наук в профилактической и клинической медицине: сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием (СПб, 3декабря 2020г.). 2020. Т. Часть 1. С. 358-363.

Тезисы
2020 год

ДНК-машина для определения nCOV-SARS-2019

Тезисы
2020 год

ДНК-машина для определения nCOV-SARS-2019